Для начала нужно найти путь проникновения пульсаций питания на звуковой выход.
Возможно, достаточно что-то выключить в микшере.
Возможно, “сдох” какой-то конденсатор, и надо его менять.
В любом случае, без подробного исследования трудно сказать что-то более определённое.
Я догадываюсь, человек из консоли пишет, так что…

Удалили потому, что NVIDIA до сих пор не обновила ветку 173 под xorg-1.10.
Варианты решения:
1) Перейти на драйвер nouveau. На FX5200 работает, включая 3D, проверено.
Установить пакеты:
xf86-video-nouveau
nouveau-dri
nouveau-firmware

2) Вернуть xorg-1.9 и nvidia-173xx
Брать можно здесь:
http://arm.konnichi.com/extra/os/i686/xorg-server-1.9.4.901-1-i686.pkg.tar.xz
http://arm.konnichi.com/extra/os/i686/xorg-server-common-1.9.4.901-1-i686.pkg.tar.xz
http://arm.konnichi.com/extra/os/i686/xf86-input-evdev-2.6.0-2-i686.pkg.tar.xz
http://arm.konnichi.com/extra/os/i686/nvidia-173xx-173.14.28-5-i686.pkg.tar.xz
Пульсации питания под меняющейся нагрузкой попадают на звуковой адаптер. Скорей всего, зависит не от ОСи, а от положения движков микшера, а также от режима питания процессора и (в вашем случае) графического процессора.
Действительно интересно, пакет пропал из extra.
Надеюсь, его вернут, когда NVIDIA снизойдёт обновить эту ветку.
Аналогично.
Правда, я в своё время не брезговал настройкой выключения по системной кнопке Power и перезагрузки по Ctrl+Alt+Del, так что обходной путь остался :)
viewtopic.php?f=4&t=6019
viewtopic.php?f=5&t=6018
Причём учётке почти год:
memberlist.php?mode=viewprofile&u=5868
Это на регистрации совсем никакой защиты или старое осталось?
P.S.
Проверил, защита стоит. Значит, в прошлом году забыли спаммера удалить.
Ну вот и “дождались”.
xorg обновился до 1.10, а NVIDIA до сих пор не обновила ветку 173 драйвера.
Сижу на xorg 1.9, в /etc/pacman.conf :
IgnorePkg   =  xorg-server xorg-server-common xf86-input-evdev
Пакет xdg-utils стоит?
То, что при запуске X идёт как – :цифра это номер “display”. Есть ещё т.н. “screen”, если он есть, то пишется через точку.
Чтобы запустить иксовую программу на нужном экране, надо при старте указать переменную DISPLAY, например
DISPLAY=":2.0" mplayer -fs 1.avi
покажет кино на весь экран на третьем X-сервере, если он уже запущен.
Не думаю чтобы lspci зависело от udev. Скорее они обе зависят от sysfs.

Если устройство действительно пропадает из lspci, то повидимому, оно выключается при перезагрузке, а включает его только BIOS при “холодном” старте.

Если это так, и при этом Дебиан успешно включал это устройство, осталось выяснить, какой модуль в дебиане за это отвечал. Возможно, его можно загрузить вручную, а может что-то сломали в ядре и придётся искать какой-то костыль.

Поиск в гугле что-нибудь дал?