Проблема решилась почти сама собой, после чистки системного блока.
А находилась она в переходнике DVI to VGA или в самом порте DVI. Переключился на другой порт и заменил(благо был еще переходник DVI to VGA) и мигание исчезло.

Спасибо за наводки.
Bump (2)
vadik
На проприетарных драйверах не проверяли?
Нет. Видеокарта уже не поддерживает.
vadik
Запустить кутешные проги из терминала и посмотреть - будут ли ошибки.
Ошибок нет.
vadik
Запустить qtconfig-qt4 и повыключать все визуальные эффекты. Заодно глянуть что за тема оформления стоит у куте-приложений.

Эффекты выключены. Тему оформления не нашел, если имелось ввиду стиль — GTK+.

P.S.
Я пробовал Live ISO Manjaro LXQT и Manjaro KDE, проблемы те же.
Есть ли какие-либо идеи?
Хотелось бы узнать, причину и по возможности способ решения следующей проблемы:
У меня стоит на ПК графическая оболочка LXQT+Openbox. Так вот когда я запускаю программы которые написаны на Qt (qt-terminal pcmanfm-qt и другие) всегда происходит мигание(blinking) [прим. экран становится черным на долю секунды, как будто он выключился] и программа запускается и все дальше работает нормально.
Все приложения которые написаны, к примеру, на GTK+ работают безо всякого мигания, как положено. LXDE и Xfce работают, также хорошо, но если даже здесь(LXDE, Xfce) запустить программу написаннную на Qt, снова произойдет назойливое мигание.

Можно ли избавиться от данного проблемного мигания?

Характеристика ПК:
Pentium 4 + Radeon X1650 + 1Gb Ram

Xorg:
Section "Device"
    Identifier "Radeon"
    Driver "radeon"
    Option      "SWcursor"              "off"
    Option      "EnablePageFlip"        "off"
    Option "ColorTiling" "on"
    Option      "AccelMethod"           "EXA"
    Option      "RenderAccel"           "on"
    Option "BackingStore" "on"
    Option      "EXAVSync"              "on"
    Option      "EXAPixmaps"            "on"
    Option      "AccelDFS"              "on"
EndSection