Так то те же яйца только в профиль (это я про ксорг) только из отдельных частей этот/etc/X11/xorg.conf.d Смысла из этого не вижу, также можно ручками и гораздо проще в самом xorg.conf. Если в нем косяки и будут то nano, vi или mc (его редактор) в помощь.