"Самое интересное решение" помогло.
Большое спасибо!
Я даже комп ребутал...
Кажется после того как обновился на последний гном.
Попробую с работы принести всю папку pam.d
Посмотрю какие различия, может поможет.
Еще ошибки нашел:
gdm-autologin][295]: gkr-pam: no password is available for user
Пакеты стоят. Правка и даже полное копирование файла не помогает :(
Если создать нового пользователя, то проблема полностью повторяется.
Автологин работает.

/etc/gdm/Xsession[419]: JS ERROR: !!! Exception was: Error: can't convert this._frame to an integer
/etc/gdm/Xsession[419]: JS ERROR: !!! message = '"can't convert this._frame to an integer"'
/etc/gdm/Xsession[419]: JS ERROR: !!! fileName = '"/usr/share/gnome-shell/js/ui/panel.js"'
/etc/gdm/Xsession[419]: JS ERROR: !!! lineNumber = '121'
/etc/gdm/Xsession[419]: JS ERROR: !!! stack = '"Animation<[email protected]/usr/share/gnome-shell/js/ui/panel.js:121
Может еще информация нужна?
В консоли залогинится получается, а в gdm нет.
Так же не могу разблокировать связку ключей.
В логах это:
/etc/gdm/Xsession[380]: (seahorse:25924): Gtk-WARNING
/etc/gdm/Xsession[380]: (seahorse:25924): Gtk-WARNING
/etc/gdm/Xsession[380]: (seahorse:25924): Gtk-WARNING
/etc/gdm/Xsession[380]: (seahorse:25924): Gtk-WARNING
/etc/gdm/Xsession[380]: (seahorse:25924): Gtk-WARNING
/etc/gdm/Xsession[380]: (seahorse:25924): Gtk-WARNING
/etc/gdm/Xsession[380]: (seahorse:25924): Gtk-WARNING
/etc/gdm/Xsession[380]: (seahorse:25924): Gtk-WARNING
/etc/gdm/Xsession[380]: (seahorse:25924): Gtk-WARNING
/etc/gdm/Xsession[380]: (seahorse:25924): Gtk-WARNING
/etc/gdm/Xsession[380]: (seahorse:25924): Gtk-WARNING
У всех все работает??