В пакете libxml2 до версии 2.9.12-6 отсутствовали скомпилированные питоновские модули. Это было исправлено в версии 2.9.12-6 и при обновлении потребуется пересохранить неотслеживаемые pyc-файлы. Если при обновлении Вы видите похожие ошибки:
libxml2: /usr/lib/python3.10/site-packages/__pycache__/drv_libxml2.cpython-310.opt-1.pyc exists in filesystem
libxml2: /usr/lib/python3.10/site-packages/__pycache__/drv_libxml2.cpython-310.pyc exists in filesystem
libxml2: /usr/lib/python3.10/site-packages/__pycache__/libxml2.cpython-310.opt-1.pyc exists in filesystem
libxml2: /usr/lib/python3.10/site-packages/__pycache__/libxml2.cpython-310.pyc exists in filesystem
выполните следующую команду:

pacman -Syu --overwrite /usr/lib/python3.10/site-packages/__pycache__/\*
такие дела.