Новая версия glibc убирает поддержку NIS и NIS+. Файл /etc/nsswitch.conf из пакета filesystem уже отражает эти изменения. При необходимости, актуализируйте содержимое этого файла перед обновлением.

Функциональность NIS может быть восстановлена при помощи установки пакета libnss_nis. Замены NIS+ в официальных репозиториях нет.

pam 1.3.0-2 не включает в себя модуль pam_unix2 и симлинки pam_unix_*.so. Перед обновлением исправьте конфигурацию в /etc/pam.d, заменив удалённый модуль на pam_unix.so. После замены пользователи pam_unix2 должны будут сбросить свои пароли. Конфигурация по умолчанию из пакета pambase не требует никаких модификаций.
такие дела.