Здравствуйте.
Поиграл с настройками nemo, теперь все директории отображаются по-разному. Как его вернуть в исходное состояние, удаление настроек из ~/user/.config и ~/user/.local не помогает, а лесть в корень страшновато.
DE - cinnamon

Всё оказалось просто, помимо основных настроек нужно смотреть контекстное меню по правой кнопке мыши, в разделе "сортировка" установки автоматически не сбрасываются и сохраняются не зависимо от остальных.